1984(昭和59)年10月、それまで全国各地に分かれて活動していた、日本の3大BMX協会、NBA(全国BMX協会)、JBA(日本BMX協会)、KBU(関西BMX競技連盟)が世界選手権参加を旗印に、組織やルールを一本化すべく努力した結果、NBA 、KBU の東西2協会とJBAの北海道支 部であったHBA(北海道BMX協会)がこの主旨に賛同し、新たに結成した上部組織 JBMXF(全日本BMX連盟)のもとに一本化しました。

1985年8月、統一規則のもとでの第1回全日本選手権大会が北海道白糠町で開催され、以降毎年全日本選手権大会において日本一を決定する競技会を実施しています。

全日本BMX連盟では、日本BMX界の代表として、1989年1月6日付けで I.BMX.F(国際BMX連盟)の日本代表団体として加盟し、同年7月、世界選手権大会(オーストラリア･ブリスベン)に3名の日本代表選手団を派遣し、以降毎年世界選手権大会に選手団を派遣している他、国内での公認国際大会の開催を行なっています。

その後、1993年からI.BMX.FとUCIが統合を開始し1994年からは世界選手権大会をUCIが主催することとなり、1996年にI.BMX.FはUCIのBMXコミッション部門として完全に統合した。2008年には北京オリンピックにおいて、BMXが正式実施されました。その後、国内でもエリートカテゴリー及びアマチュアカテゴリーにおいても登録がJCF(公益財団法人日本自転車競技連盟)となる組織整備が行われ、現在に至っています。